O pessoal estava trabalhando nesta versão desde o fim de 2014. Os desenvolvedores dizem que esta versão é mais rápida do que a anterior e que ela foi desenvolvida com retrocompatibilidade em mente - ou seja, o que você já usava na antes continuará funcionando.
Vários workarounds(também conhecidos como gambiarras) feitas especificamente para as versões mais antigas do IE foram removidas e a biblioteca agora utiliza recursos das APIs mais modernas onde faz sentido.
A ideia é que atualizem as versões anteriores caso hajam correções críticas a serem feitas, mas elas não vão ganhar mais novas funcionalidades. A versão 3 é o futuro do jQuery.
Você pode pegar baixar a versão mais nova aqui: https://code.jquery.com/jquery-3.0.0.js Versão minificada: https://code.jquery.com/jquery-3.0.0.min.js
E pode ler muito mais detalhes do que mudou e tem de novo aqui.
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